Школа открыта в 1967 году, в год 50-летия Великой Октябрьской Социалистической революции, потому и носит такое имя.
К осени 2004 года школа им. 50-летия октября и школа им. Дорохова объединены в одну - школа № 3 МО РФ. На тот момент в школе им. 50-летия Октября был расположен старший блок (5 - 11 классы), а в школе им. Дорохова - младший блок (1 - 4 классы).
Сейчас это единая общеобразовательная школа Министерства Обороны РФ №3.